《智慧財產法院組織法》部分條文修正自2014年6月6日起施行
【資料來源：總統府公報/司法院】
2014年6月4日華總一義字第10300085271號總統令公布《智慧財產法院組織法》刪除第28條及第29條條文；並修正第3條、第7條附表、第8條至第10條、第12條、第17條、第18條、第21條至第24條、第26條及第27條條文，自6月6日起施行。
第3條（修正）
【立法目的】因違反營業秘密法及智慧財產案件審理法第35條第1項、第36條第1項案件，不服地方法院依通常、簡式審判或協商程序所為之第一審裁判而上訴或抗告之刑事案件，屬智慧財產法院管轄案件。
智慧財產法院管轄案件如下：
一、依專利法、商標法、著作權法、光碟管理條例、營業秘密法、積體電路電路布局保護法、植物品種及種苗法或公平交易法所保護之智慧財產權益所生之第一審及第二審民事訴訟事件。
二、因刑法第二百五十三條至第二百五十五條、第三百十七條、第三百十八條之罪或違反商標法、著作權法、營業秘密法、公平交易法第三十五條第一項關於第二十條第一項、第三十六條關於第十九條第五款及智慧財產案件審理法第三十五條第一項、第三十六條第一項案件，不服地方法院依通常、簡式審判或協商程序所為之第一審裁判而上訴或抗告之刑事案件。但少年刑事案件，不在此限。
三、因專利法、商標法、著作權法、光碟管理條例、積體電路電路布局保護法、植物品種及種苗法或公平交易法涉及智慧財產權所生之第一審行政訴訟事件及強制執行事件。
四、其他依法律規定或經司法院指定由智慧財產法院管轄之案件。
第8條（修正）
【立法目的】刪除智慧財產法院院長、庭長、法官之官等、職等及法官晉敘升等之規定。（修正條文第8條至第10條）
①智慧財產法院置院長，由法官兼任，綜理全院行政事務。
②智慧財產法院院長，應就具有最高法院法官、最高行政法院法官或最高法
③院檢察署檢察官任用資格，並有領導才能者遴任之。
第9條（修正）
①智慧財產法院之庭數，視事務之繁簡定之，必要時得設專庭。
②各庭置庭長一人，除由兼任院長之法官兼任者外，餘就法官中遴兼之，監督各該庭事務。
第10條（修正）
①智慧財產法院置法官、試署法官。
②司法院因應業務需要，得調地方法院及其分院試署法官或候補法官至智慧財產法院辦事，協助法官辦理案件程序之進行、爭點之整理、資料之蒐集、分析及裁判書之草擬等事項。
③試署法官或候補法官調智慧財產法院辦事期間，計入其試署法官或候補法官年資。
④智慧財產法院置法官助理，依聘用人員相關法令聘用專業人員，或調派各級法院或行政法院其他司法人員或借調其他機關適當人員充任，協助法官辦理案件程序之進行、爭點之整理、資料之蒐集、分析等事項。
⑤具專業證照執業資格者，經聘用充任法官助理期間，計入其專業執業年資。
⑥法官助理之遴聘、訓練、業務、管理及考核等相關事項，由司法院定之。
第12條（修正）
①智慧財產法院設公設辯護人室，置公設辯護人，簡任第十職等至第十一職等或薦任第九職等；其合計在二人以上者，置主任公設辯護人，簡任第十職等至第十二職等。
②前項公設辯護人繼續服務四年以上，成績優良，經審查合格者，得晉敘至簡任第十二職等；已依法院組織法第十七條第二項、第三項、少年及家事法院組織法第十一條第二項、第三項規定晉敘有案者，得敘至簡任第十二職等。
③前項智慧財產法院公設辯護人之服務年資與曾任高等法院或其分院公設辯護人之服務年資，合併計算。
④第二項之審查辦法，由司法院定之。
第17條（修正）
【立法目的】增訂智慧財產法院書記處分科、分股之事項，由司法院定之。
①智慧財產法院設書記處，置書記官長，薦任第九職等至簡任第十一職等，承院長之命處理行政事務；一等書記官，薦任第八職等至第九職等；二等書記官，薦任第六職等至第七職等；三等書記官，委任第四職等至第五職等，分掌紀錄、文書、研究考核、總務、資料及訴訟輔導事務；並得分科、分股辦事，科長由一等書記官兼任，股長由一等書記官或二等書記官兼任，均不另列等。但一等書記官人數少於設科數，且有業務需要時，科長得由二等書記官兼任之。
②前項一等書記官、二等書記官總額，不得逾同一智慧財產法院一等書記官、二等書記官、三等書記官總額二分之一。
③第一項所定分科、分股及兼任、免兼等事項，由司法院定之。
第18條（修正）
【立法目的】智慧財產法院提存所改置二等書記官、三等書記官，並定其官、職等。
智慧財產法院得設提存所，置主任，簡任第十職等；二等書記官，薦任第六職等至第七職等；三等書記官，委任第四職等至第五職等。
第21條（修正）
【立法目的】智慧財產法院人事室、會計室、統計室及政風室增置專員，並定其官、職等。（修正條文第21條至第23條）
智慧財產法院設人事室，置主任，薦任第九職等至簡任第十職等；並得置專員，薦任第七職等至第八職等；科員，委任第五職等或薦任第六職等至第七職等，依法辦理人事管理事項。
第22條（修正）
智慧財產法院設會計室、統計室，各置主任，均薦任第九職等至簡任第十職等；並得置專員，薦任第七職等至第八職等；科員，委任第五職等或薦任第六職等至第七職等，依法分別辦理歲計、會計及統計等事項。
第23條（修正）
智慧財產法院設政風室，置主任，薦任第九職等至簡任第十職等；並得置專員，薦任第七職等至第八職等；科員，委任第五職等或薦任第六職等至第七職等，依法辦理政風事項。
第24條（修正）
①智慧財產法院設資訊室，置主任，薦任第九職等至簡任第十職等；設計師、管理師，均薦任第六職等至第八職等；助理設計師，委任第四職等至第五職等或薦任第六職等，處理資訊事項。
②前項薦任助理設計師員額，不得逾同一智慧財產法院助理設計師總額二分之一。
第26條（修正）
【立法目的】增訂臺灣高等法院檢察署智慧財產分署處務規程，授權法務部定之。
①智慧財產法院之處務規程，由司法院定之。
②臺灣高等法院檢察署智慧財產分署之處務規程，由法務部定之。
第27條（修正）
【立法目的】智慧財產法院設法官會議；法官會議之組成、召開事項、議決事項及議決程序等事項，適用法官法之規定。
①智慧財產法院設法官會議。
②法官會議之組成、召開時間、議決事項及議決程序等事項，適用法官法第四章之規定。
第28條、第29條（刪除）
【刪除理由】刪除法官會議主席及表決方式、法官事務分配、代理次序及合議庭法官配置變更方式等規定。（刪除第28條、第29條）
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