需先在中國大陸主張權利才能請求兩岸商標協處

智慧局統計截至2010年底止，台灣廠商請求兩岸商標協處的案件總計有41件；對此，智慧局王美花局長強調：台灣廠商請求兩岸協處前，一定要在中國大陸已經曾主張權利，台灣官方才能協助廠商協處，但是對於「文字相同、圖案不同」或「圖案相同、文字不同」的近似案件，在屬地主義原則下，台灣官方也無能為力。

智慧局表示，在41件兩岸商標協處案件中，9件是通報後已經完成協處，7件沒有通報，主要是因為廠商在中國大陸未申請商標，在中國大陸沒有主張權利，所以智慧局也無法為廠商進行協處；此外，部分廠商的情形是中國大陸與台灣的商標案「文字相同、圖案不同」或「圖案相同，文字不同」，中國大陸廠商確定沒有抄襲或搶註，只是比台灣廠商早一點申請商標註冊，在屬地原則下，這種類似案件沒有協處空間。

另外，目前有25件正在協處中，廠商請求協處較常見的類型為：台灣廠商的商標遭到搶註，需請求中國大陸暫緩審議，並加速審查前一案搶註商標的異議或撤銷。此種情況，台灣廠商如果直接向中國大陸提出商標申請，因為前案已經註冊，肯定會被駁回，因此台灣方面就要協助廠商舉證，商標在中國大陸遭到搶註。

另一種類型是：台灣智慧局已經核發商標權給台灣廠商，台灣廠商欲以相同商標在中國大陸提出申請，卻因為兩岸文化背景與語言差異，遭到中國大陸商標局以缺乏顯著特徵、有害於社會主義道德風尚或有其他不良影響等事由，而駁回廠商的申請。